科协组织恢复时，正是十一届三中全会前后。裴丽生接到反映历史遗留问题的信件时，都立即批示有关职能部门同当地党政部门联系，一件一件地加以落实，有的还直接反映给省市党政领导。如著名柑桔专家曾勉的政策落实问题，连续抓了几年才见到成效。

中青年科学家是科技队伍的中坚，工作担子很重，家庭负担也很重。80年代初期，中青年科学家早逝和患病屡屡发生。

裴丽生多次主持会议，讨论保护中青年科学家问题，并向社会呼吁，向组织部门反映。对年老多病的科学家，他常常挤出时间，登门拜访。

有一年夏天，高龄的裴丽生到上海考察工作时，冒着酷暑，到华东医院探望著名生物化学家曹天钦，又及时向上海有关方面反映曹先生的要求。

围绕将科协办成科技工作者之家这个宗旨，裴丽生还组织职能部门为科技工作者工作条件和生活条件的改善而呼吁；对杨联康等有突出贡献的科学家及时开大会予以表彰，并开展向他们学习的活动；开展科技人员的继续教育，为在职科技工作者学习新兴学科领域的知识创造条件；在学会领导班子的选举中增加中青年成分，推荐和培养新一代学科带头人；向党政领导岗位推荐有组织能力的科学家；推广重庆离退休科技工作者协会的经验，为离退休科技工作者发挥余热创造条件。

1983年，中国科协成立科技咨询服务中心，裴丽生、华罗庚为总顾问，由20多位各有关方面的专家组成的中心委员会进行领导。科协系统的咨询服务工作此后就蓬蓬勃勃地开展起来了。

1984年初，国际上正在兴起新技术革命热潮。裴丽生感到对干部进行新技术革命知识教育，是关系到我国能否追踪世界先进技术，站到新的产业革命前列的极为重要的事情。

为此，他请中国科协的有关部门迅速与中共中央组织部、劳动人事部、国家科委、中央直属机关党委、中央国家机关党委联系，及时举办了20次《新技术革命知识讲座》，聘请全国知名学者专家钱学森、马洪、宦乡等21人讲课，听课的都是中央、国家机关司局级以上领导干部。事后编成集子出版，发行30万册，在全国有较大影响。

裴丽生非常重视科协系统的干部培训工作、科协自身的理论研究和科协活动规律的探讨。他积极促成科协干部培训班的建立，分期分批轮训干部，讲授科学技术发展史、自然辩证法、科学管理和科技群众团体概论。这个培训班有效地提高了科协干部的科学素质。

裴丽生在国家科委第二期科技管理研究班和中国科协第三期科技管理干部学习班上，作了《关于科学技术群众团体及其活动的初步探讨》《科协的工作任务与自身建设》两次讲课。